国家保密科学技术研究所建所以来取得100余项科研成果，开发出20多项保密技术产品，制定了20余项国家保密标准，获得国家科技进步二等奖1项，取得3项国家重点新产品证书，获得中央办公厅科技进步一等奖1项、二等奖10项和三等奖11项。

成果展示---工程
　　研究所承担并完成了一些国家重大科技攻关项目和一些国家重要涉密信息系统的工程建设

成果展示---产品
　　研究所研究开发了一系列保密技术产品并得到了广泛的应用
　　● 机要文件交换自动化管理系统
　　● VIP微机视频信息保护机
　　● VCR微机视频信息检查接收系统 
　　● TLT电话线路测试仪
　　● 内部网保密网关
　　● Internet信息保密检查搜索器
　　● 安全隔离与信息交换系统
　　● 安全隔离与信息单向传输系统
　　● 涉密信息系统保密检查工具
　　● 涉密文件防非授权携带报警系统

成果展示---软课题
　　国家“863”计划
　　研究所承担并完成了一些电磁泄漏发射检查与防范研究项目 

　　国家自然基金项目
　　● “信息设备交叉调制电磁泄漏发射技术研究”

　　国务院信息办项目
　　● 信息资源的安全与保密
　　●《电子政务保密管理指南》制定

　　全国信息安全标准化技术委员会项目
　　● 信息安全标准化体系与国际信息安全标准跟踪研究
　　● 涉密信息系统分级保护标准框架及相关标准研究

　　国家保密局项目
　　●《国家保密局1998－2000年科研规划》制定
　　●《国家保密局“十五”保密技术科研规划》制定
　　●《涉及国家秘密的通信、办公自动化和计算机信息系统审批暂行办法》制定
　　● 国际窃密与保密技术现状和发展动向的分析研究报告
　　● 涉密网络相关技术应用研究
　　● 计算机磁介质存贮信息消除理论分析和消除技术研究